Bedste gratis Molecular Modeling-software til Windows 10

I denne artikel vil vi dække den bedste gratis Molecular Modeling-software til Windows 10 PC. Ved at bruge disse freeware kan du skabe modeller af forskellige simple til komplekse kemiske forbindelser. Denne softwaresamling er nyttig for studerende i bioinformatik, kemiteknik osv. Du kan tilføje forskellige elementer fra det periodiske system(Periodic Table) for at danne en kemisk forbindelse. Desuden kan du i denne software også se en kemisk forbindelse i forskellige stilarter, såsom wireframe, kugle og pind, rør, kugle og cylinder(wireframe, ball and stick, pipes, ball and cylinder) og mere.

Molecular Modeling software til Windows 10

Nogle af disse software inkluderer også forskellige kemiske grupper og strukturer for din bekvemmelighed. Du skal blot(Simply) vælge dem, og din kemiske model er klar. Eksempler på kemiske grupper omfatter  alkoholer, benzen, aldehyder, aminosyrer(alcohols, benzene, aldehydes, amino acids) osv. Udover det kan du også lave kemiske beregninger som  energi, bindingslængde(energy, bond length) osv.

  1. Avogadro
  2. MoluCAD
  3. ArgusLab
  4. Ascalaph Designer

Lad os tage et kig på dem.

1] Avogadro

Bedste gratis molekylær modelleringssoftware Avogadro

 Avogadro  er et fremragende freeware til molekylær modellering, der kommer med masser af funktioner. Dens brugervenlige grænseflade gør det let at forstå for brugerne. Når du starter softwaren, vil du se en sort skærm og et panel i venstre side. Du kan få adgang til nogle almindeligt anvendte elementer fra " rullemenuen(drop-down menu) " i venstre panel. Hvis du vil have adgang til alle elementerne, skal du blot klikke på " andet(other) " i rullemenuen, og softwaren starter det periodiske system(Periodic Table) . Elementet, som du vælger fra det periodiske system(Periodic Table) , vil være tilgængeligt i rullelisten.

Trin til at tegne en kemisk forbindelse:

  1. Vælg(Select) et element fra rullemenuen i venstre panel, og klik på den sorte skærm for at tilføje det.
  2. Vælg nu et andet element fra rullemenuen.
  3. Tryk og hold venstreklik på musen, og træk det til det første element for at forbinde det med en kemisk binding. Du kan også vælge typen af ​​kemisk binding, enkelt, dobbelt eller tredobbelt.

Der er forskellige knapper på softwarens værktøjslinje:

  • Tegneværktøj(Draw tool) : Det lader dig tegne forskellige molekylære forbindelser.
  • Navigationsværktøj(Navigation tool) : Ved at bruge det kan du flytte, rotere, zoome ind og zoome ud af den molekylære model.
  • Bindingscentrisk manipulationsværktøj(Bond centric manipulation tool) : Vælg dette værktøj, og klik på en af ​​bindingerne for at se vinklen.
  • Automatisk rotationsværktøj(Auto rotation tool) : Vælg dette værktøj, og klik på knappen " Start ". Tryk nu på og hold venstre museklik nede og træk den i en hvilken som helst retning. Slip venstre klik, og den molekylære model vil begynde at rotere automatisk.

Hvis du vil ændre størrelsen på bindingslængden af ​​forbindelser automatisk, skal du gå til " Extensions > Optimize Geometry " eller trykke på " Ctrl+Alt+O ." For at beregne energien skal du gå til " Extensions > Molecular Mechanics > Calculate Energy ."

Lagring af filen(Saving the File) : Du kan gemme dit projekt i flere formater, inklusive  PDB, ENT, CHM, ALC, CDXML, CDX, C3D2, C3D1, SD, SDF, DMOL, CHT, GAM . Udover dette er der også en eksportmulighed tilgængelig, ved hjælp af hvilken du kan gemme dit projekt i  PDF, SVG, BMP, JPG, PNG osv.

2] MoluCAD

Bedste gratis Molecular Modeling-software til Windows 10

MoluCAD  er et andet gratis freeware til molekylær modellering på denne liste. Ligesom Avogadro kommer den også med en masse funktioner. I denne software kan du se både 2D- og 3D-visninger ved siden af. Nogle almindeligt anvendte elementer er tilgængelige på venstre panel af softwaren. For at tilføje det til hovedrummet skal du blot klikke på et af elementerne. Hvis det element, du vil tilføje, ikke er tilgængeligt der, kan du vælge det fra det periodiske system(Periodic Table) . For at se det periodiske system(Periodic Table) skal du højreklikke på det sorte felt og klikke på knappen " Tilføj atom(Add Atom) ".

Trin til at tegne en kemisk forbindelse:

  1. Klik(Click) på et af elementerne i venstre panel for at tilføje det.
  2. Klik(Click) på et andet element for at tilføje det, eller du kan vælge det fra det periodiske system(Periodic Table) .
  3. For at forbinde elementerne, gå til " Add > Bonds – Connect Atoms " og vælg typen af ​​kemisk binding. Klik nu på det første atom og klik derefter på det andet.

Udover grundstoffer kan du også tilføje forbindelser. På det højre panel finder du forskellige  molekyler, aminosyrer, funktionelle grupper, ensomme par atomer(molecules, amino acids, functional groups, lone pair atoms) osv. Vælg en hvilken som helst struktur og træk og slip den til hovedrummet. Du kan beregne energien af ​​molekylerne ved at klikke på " Energy > Evaluate Energy ."

Ved at bruge menuen " Forespørgsel(Query) " kan du beregne  afstanden mellem to atomer, bindingslængde, bindingsvinkel, torsionsvinkel, massemidtpunkt(distance between two atoms, bond length, bond angle, torsion angle, the centre of mass) osv. Du kan se 3D-strukturen i fire forskellige visninger,  top, front, side og skrå(top, front, side, and oblique) . Gå til " View > Graphics Mode " for at se modellen i forskellige former, såsom  bold og pind, space fill, pipes(ball & stick, space fill, pipes) og mere.

Lagring af filen(Saving the file) : Du kan gemme projektet i MCD -format. Hvis du bruger " Eksporter(Export) " i menuen " Filer(File) ", kan du gemme dit projekt i  JPEG-  og  Windows BITMAP-  formater.

3] ArgusLab

Bedste gratis molekylær modelleringssoftware ArgusLab

ArgusLab  er en anden brugervenlig molekylær modelleringssoftware, der kommer med letforståelige funktioner. Ved hjælp af denne software kan du skabe strukturen af ​​forskellige kemiske forbindelser. På venstre panel af softwaren er tre faner tilgængelige:

  • Atomer(Atoms) : Denne fane indeholder forskellige elementer i det periodiske system(Periodic Table) . Når du klikker på hvert atom, viser softwaren dets geometri. Klik(Click) på knappen " Periodic Table " for at starte det periodiske system(Periodic Table) .
  • Ringe(Rings) : Her får du forskellige typer kemiske ringstrukturer.
  • Aminosyrer(Amino Acids) : Denne fane viser forskellige typer aminosyrer. På denne fane er " Polypeptide Builder " også tilgængelig.

Trin til at tegne kemisk forbindelse:

  1. Klik på " Atom "-fanen i venstre panel for at tilføje et element.
  2. Vælg(Select) et af de tilgængelige elementer. Hvis dit ønskede element ikke er der, kan du vælge det samme fra det periodiske system(Periodic Table) .
  3. Brug(Use) højreklik for at placere elementet på det angivne felt.
  4. Vælg(Select) et andet element. Vælg nu det sidste element ved hjælp af venstreklik og placer det andet element ved hjælp af højreklik. Dette vil forbinde de to elementer og danne en forbindelse.
  5. Følg de samme trin for at tilføje ringe og aminosyrer i rummet.

4] Ascalaph Designer

Bedste gratis Molecular Modeling Software Ascalaph Designer

Ascalaph Designer  er endnu et godt freeware til molekylær modellering. Den bedste del af softwaren er, at du ikke behøver installere den på din pc. Den kommer med en eksekverbar fil. Softwaren vil blive downloadet i zip-format. Efter udpakning vil du finde den eksekverbare fil i mappen " bin ".

Trin til at tegne en kemisk forbindelse:

  1. Tryk på " Ctrl+N " for at starte et nyt projekt.
  2. For at tilføje elementer skal du åbne det periodiske system(Periodic Table) . For dette skal du gå til " Build > Free Drawing ."
  3. Vælg(Select) et hvilket som helst af elementerne og placer dem i mellemrummet ved at trykke på " Ctrl+Shift "-tasterne.
  4. Placer et andet element ved hjælp af ovenstående trin, og træk det til det sidste element for at forbinde dem med en kemisk binding.

Du kan se alle sammensætninger i forskellige former som  bold og pind, wireframe, CPK(ball and stick, wireframe, CPK) osv., ved at klikke på knapperne i højre panel. Når du vælger et element fra det periodiske system(Periodic Table) , viser det dig yderligere information som  elementnavn, hybridisering, kovalent og Van Der Waals tiltrækningskræfter(element name, hybridization, covalent, and Van Der Waals forces of attraction) . Klik på menuen " Analyser(Analyze) " for at udføre forskellige beregninger, herunder  energi, temperatur, tryk, dipolmoment(energy, temperature, pressure, dipole moment) osv.

Lagring af filen(Saving the file) : Du kan kun gemme dit projekt i dets egne formater, inklusive  mim, hin, xmolmmol, smol  osv. Dette er ulempen ved dette freeware.

Vi håber, du fandt dette indlæg nyttigt til dine skole- og universitetsprojekter.



About the author

Jeg er softwareudvikler med over 10 års erfaring. Jeg har specialiseret mig i Mac-programmering og har skrevet flere tusinde linjer kode til forskellige Mac-programmer, inklusive, men ikke begrænset til: TextEdit, GarageBand, iMovie og Inkscape. Jeg har også erfaring med Linux og Windows udvikling. Mine færdigheder som udvikler giver mig mulighed for at skrive omfattende tutorials af høj kvalitet til forskellige softwareudviklingsplatforme - fra macOS til Linux - hvilket gør mine tutorials til det perfekte valg for dem, der ønsker at lære mere om de værktøjer, de bruger.



Related posts